Nació en Tarrasa (Barcelona) el 15 de junio de 1937.

Estudió humanidades y filosofía en el Seminario de Barcelona (1949-1957). Fue ordenado sacerdote el 17 de septiembre de 1961; doctor en Historia de la Iglesia (Pontificia Universidad de Salamanca), diplomado en Paleografía, Diplomática y Archivística (Archivo Secreto del Vaticano, 1971), estudios de Biblioteconomía (Roma, 1972), de Informática y Archivos (Madrid, Ministerio de la Presidencia, 1975).

Capellán de la Casa General de las Hermanas Misioneras de la Natividad de Nuestra Señora (1972). Canónigo de la Santa Iglesia Catedral Basílica de Barcelona (1988).
Después de sus estudios en la Pontificia Universidad de Salamanca fue profesor y superior del Seminario Menor de Barcelona (1962-1966). Desde 1972 es profesor de metodología e historia de la iglesia de la Facultad de Teología de Cataluña. Profesor de Historia de la Iglesia y Patrología en el Instituto Superior de Ciencias Religiosas de Barcelona (1985). Profesor del "Aula de personas mayores" (Universidad de Barcelona, 1988). Fue profesor de la Escuela de Documentalistas de Madrid (1985-1989), del máster en Archivística de las universidades de Barcelona y Madrid (1988-1990). Vocal del Instituto de Teología de Barcelona (1991).

Director del Archivo Diocesano de Barcelona, de la Biblioteca Pública Episcopal y del Museo Diocesano de Barcelona. Delegado diocesano del patrimonio artístico y documental del Arzobispado de Barcelona. Director del Secretariado Interdiocesano de Custodia y Promoción del Arte Sacro (S.I.C.P.A.S.), Subdelegado de la Conferencia Episcopal Tarraconense en la comisión coordinadora Iglesia-Generalitat de Catalunya para el Patrimonio Cultural. Delegado episcopal del Patrimonio Cultural del Arzobispado de Barcelona. Presidente de la Fundación Sanabre de Barcelona y vocal de la Fundación Tavera (Madrid). Miembro del Instituto Histórico Eclesiástico de Roma (1972). Miembro de la Fundación Soler y Palet de Tarrasa (1973-1980). Becario de la Fundación J. March (1978-1979). Miembro de la Junta de Museos de Tarrasa (1978-1981). Miembro del Consejo de Cultura de Cataluña (1981-1983). Secretario (1981-1985) y Presidente (1985-2001) de la Asociación de Archiveros de la Iglesia en España. Miembro de la Comisión Mixta Estado español e Iglesia (1983-1987). Miembro de la Comisión Asesora de Archivos de la Generalitat de Catalunya (1984-1986). Miembro del Consejo de Redacción de las revistas "Hispania Sacra" (1985-1991), "Taüll" (1985-1987) y "Analecta Sacra Tarraconensis" (1985). Miembro del Patronato del Monasterio de Sant Cugat (1986). Miembro del Instituto Amatller de Arte Hispánico (1990). Miembro de la Junta de Museos de Cataluña (Consejo ejecutivo) (1991). Miembro de la Comisión Asesora del Monasterio de Pedralbes (1993). Canónigo archivero de la Catedral de Barcelona (1996).

Socio de honor de los Amigos de los Gozos. Egarense del año (1978). Premio San Ramón de Peñafort (1984). Medalla de oro de los Amigos de los Museos de Cataluña (1986). "Creu de Sant Jordi" de la Generalitat de Catalunya (1990). Premio Palau-Investigación Científica (1993). Medallas de oro de los anticuarios y coleccionistas de Cataluña, del Centro de Filatélicos de Cataluña y del Círculo Artístico del Liceo de Barcelona (1997).

Comisario del Pabellón de Cataluña en la Expo de Sevilla de 1992 (sección arte). Secretario del Capítulo Catedral (1993-1997). Conservador de la Catedral de Barcelona (1997). Miembro de la comisión de los preparativos de las bodas reales de la Infanta Cristina (1997). Coordinador del "Proyecto Catedral" junto con la Generalitat de Catalunya, el Ayuntamiento de Barcelona y la Fundación Caja de Pensiones de Barcelona, para la restauración y conservación con estudios de la patología de la piedra, estudios históricos de la Catedral, vitrales, instrumentos didácticos, iluminación,...

Ha sido ponente en congresos y cursillos en las universidades de Madrid (Complutense), Barcelona, Deusto, Toulouse, Varsovia, Roma, Alcalá de Henares, Lyon, etc. Ha participado en diversos congresos en Santiago de Compostela, Zaragoza, Logroño, Soria, Valle de los Caídos, Toledo, Córdoba, Granada, Oviedo, Roma, Valencia, Sevilla, etc. Congresos de restauración y conservación del Patrimonio Cultural de España y de la Iglesia. Ha organizado y presidido trece congresos y nueve cursillos de archivística de la Asociación de Archiveros Eclesiásticos de España. Participó y pronunció una conferencia en el "Forum Europeo" (Roma, mayo de 1993). Cursos en diversas entidades universitarias de Alemania, Italia y Estados Unidos. Conferencias en el Liceo de Barcelona (1996-1997), Asociación de Museos, Círculo Ecuestre de Barcelona y en las universidades de Barcelona y Bosnia.

Propuso en 1975, bajo la dirección de la "Secretaría del Episcopado Español", el cambio de formularios de los libros sacramentales. La Conferencia Tarraconense lo impuso, y también en otras diócesis de España acceptaron estos formularios (en castellano y euskera) adaptados a la informática y a la microfilmación. Inició la organización del Archivo de la Conferencia Episcopal Española (1981).

Director del sistema informático Lumen de informatización digital aplicado a los archivos de la iglesia española y la Conferencia Episcopal. El año 1972 inició la remodelación del Archivo diocesano y de la Biblioteca Episcopal. El año 1989 también inició la catalogación del Museo Diocesano y a la vez la remodelación del insigne edificio de la Pía Almoina para la definitiva instalación de este museo. Dirige el plan de remodelación y restauración de la Catedral de Barcelona en la campaña de los 700 años de la primera piedra de la catedral gótica.

Ha dirigido y formado parte de tribunales de tesinas y tesis doctorales, tanto en la Facultad de Teología de Cataluña como en la Universidad de Barcelona.

Ha impulsado una docena de exposiciones ("Thesaurus", "Millenum", "Splendor", "Selecta", "Scripturaria", "Gaudí, el hombre y su obra"). En "Millenum" contó con la codirección de Jordi Bonet Armengol.

Ha impulsado los estudios archivísticos y de la historia del arte en la iglesia de España y ha dirigido monografías de las parroquias del Arzobispado de Barcelona (unas dos docenas). También ha iniciado un programa de diálogo con los artistas actuales y diversos simposios en el proyecto denominado "La Rectoría, Sant Pere de Vallmajor" donde se reunen artistas, pintores, orfebres, escultores y arquitectos de diversas naciones (Japón, Hungría, Argentina, Perú, Colombia, Canadá, Francia, EE.UU., Inglaterra, Rusia, Polonia, Alemania, México,...). Ha iniciado una "escuela de monitores culturales" para la Catedral y el Museo Diocesano de Barcelona (1994). Conjuntamente con la Generalitat de Catalunya ha elaborado el inventario de bienes muebles de Cataluña ("Inventario de los bienes muebles de la Iglesia Catalana", 1989). También dirige el "Catálogo Monumental del Arzobispado de Barcelona", el censo de los archivos y bibliotecas de la Iglesia en España y el inventario de los archivos de cofradías de España.

Elegido académico de honor de la Reial Acadèmia Catalana de Belles Arts de Sant Jordi el 17 de febrero de 2010, aprobando así la propuesta en su día presentada por los académicos de número Jordi Bonet Armengol, Leopoldo Gil Nebot y Joan Uriach Marsal.

Publicaciones:
. Josep M. MARTÍ BONET: "Evolució paleogràfica del nom de Terrassa". 1975.
. Josep M. MARTÍ BONET: "Roma y las iglesias particulares en la concesión del palio a los obispos y arzobispos de Occidente". 1976.
. Josep M. MARTÍ BONET: "83 pergamins del Monestir de Sant Llorenç de Terrassa (segles X-XI). 1978.
. Josep M. MARTÍ BONET: "Las bulas del Papa Alejandro III dirigidas a los obispos de Barcelona". 1980.
. Josep M. MARTÍ BONET: "1000 anys d'història i descobertes arqueològiques a les esglésies de Cardedeu". 1980.
. Josep M. MARTÍ BONET: "Epistolario del Dr. Masmitjà, fundador de la Congregación de religiosas 'Corazón de María'". 1981.
. Josep M. MARTÍ BONET, Leandro NIQUI PUIGVERT, y Fèlix MIQUEL MASCORT: "Ponç de Gualba. Obispo de Barcelona (a. 1303-1334). Visitas pastorales y Registro de Comunes". Volum 1. Arxiu Diocesà de Barcelona. Burgos, 1983.
. Josep M. MARTÍ BONET (coord.). Lluís BONET ARMENGOL, Fèlix MIQUEL MASCORT, Leandre NIQUI PUIGVERT, Carme del BLANCO BARNUSELL, Pere Jordi FIGUEROLA ROTGER, Xavier SALA MARTÍ, y Francesc Xavier ORPINELL MARCO (colaboradores): "Catàleg monumental de l'Arquebisbat de Barcelona. Volum VI/1. Sant Vicenç de Sarrià. 1000 anys d'història". Arxiu Diocesà de Barcelona. Akribos Edicions. Barcelona, 1987.
. Josep M. MARTÍ BONET, Romà CASTRO ALCAIDE, y Assumpció COLOMÉS AMENGUAL: "Els 'Josepets'. Parròquia de la Verge de Gràcia i Sant Josep. 300 anys d'història". Arxiu Diocesà de Barcelona. Akribos Edicions. Barcelona, 1987.
. Josep M. MARTÍ BONET, Lluís BONET ARMENGOL, y Isabel JUNCOSA i GINESTÀ: "Costums i tradicions religiosos de Barcelona. 'Calaix de sastre'. Rafael d'Amat i de Cortada i de Santjust. Baró de Maldà". Arxiu Diocesà de Barcelona. Biblioteca Pública Episcopal de Barcelona. Akribos Edicions. Barcelona, 1987.
. Josep M. MARTÍ BONET, y Pere Joan LLABRÉS MARTORELL: "Set segles i mig de germanor. Esglésies de Mallorca i del Principat 1238-1988. Miscel·lània commemorativa". Arxiu Diocesà de Barcelona. Centre d'Estudis Teològics de Mallorca. Akribos Edicions. Barcelona, 1988.
. Salvador MISSER, Pere Jordi FIGUEROLA, y Josep M. MARTÍ BONET (coords.). Carme del BLANCO, Joan ESCALA, Leandre NIQUI, Ignasi QUER, y Francesc TENA (colaboradores): "Catàleg monumental de l'Arquebisbat de Barcelona. Volum V/1. Olesa de Bonesvalls. Parròquia de Sant Joan i hospital de Cervelló". Arxiu Diocesà de Barcelona. Akribos Edicions. Barcelona, 1993.
. Pere Jordi FIGUEROLA, y Josep M. MARTÍ BONET (coords.). Núria FONTANALS, Ignasi QUER, Pilar RUIZ DE LUNA, y Francesc TENA (colaboradores): "Catàleg monumental de l'Arquebisbat de Barcelona. Volum VI/2. La Rambla. Els seus convents. La seva història". Arxiu Diocesà de Barcelona. Akribos Edicions. Barcelona, 1995.
. Pere GIBERT, Josep M. MARTÍ BONET: "Palau-Solità 'títol de glòria'". Editorial Escudo de Oro. Barcelona, 1995 (2ª edición).
. Josep M. MARTÍ BONET: "La Catedral de Barcelona". 1997.
. Carles COLL COLOMER, Enric GARCIA-PEY, Josep M. MARTÍ BONET, Jaume MASVIDAL, Leandre NIQUI, Joan PORTALS, Xavier RENAU, Jaume SALICHS, Jaume SALICHS OLIVERAS, y Antoni SALICHS OLIVERAS: "Història de Gualba, la vall de les aigües blanques". Arxiu Diocesà de Barcelona. Barcelona, 2000.
. Josep M. MARTÍ BONET: "Història de l'església medieval. Naixement, infantesa i joventut d'Europa". Arxiu Diocesà de Barcelona. Barcelona, 2000.
. Josep M. MARTÍ BONET: "Història de l'església antiga". Arxiu Diocesà de Barcelona. Barcelona, 2000.
. Francesc MUÑOZ ALARCÓN, Josep M. MARTÍ BONET, y Fidel CATALÁN CATALÁN: "Gregorio Modrego Casaus. Bisbe del XXXV Congrés Eucarístic Internacional de Barcelona". Editorial Claret. Barcelona, 2002.
. Josep M. MARTÍ BONET: "Oleguer. Servent de les esglésies de Barcelona i Tarragona". Arxiu Diocesà de Barcelona. Barcelona, 2003.
. Josep M. MARTÍ BONET: "Barcelona i Ègara-Terrassa. Història primerenca fins l'alta edat mitjana de les dues esglésies diocesanes". Arxiu Diocesà de Barcelona. Barcelona, 2004.
. Josep M. MARTÍ BONET: "La memòria de les nostres esglésies diocesanes (Barcelona, Terrassa i Sant Feliu de Llobregat) i Sant Martí de Cerdanyola, glossa sobre el seu orígen i el seu context històric diocesà". Arxiu Diocesà de Barcelona. Barcelona, 2005.
. J.M. MARTÍ BONET, J.M. JUNCÀ RAMON, L. NIQUI PUIGVERT, L. BONET ARMENGOL, F. MIQUEL MASCORT, P.J. FIGUEROLA ROTGER: "La Inquisición y el falso cardenal de Borbón. El español que burló al imperio napoleónico". 2005.
. Josep M. MARTÍ BONET: "Historias de los cónclaves y del papado". La Vanguardia. Barcelona, 2005.
. Josep M. MARTÍ BONET (coord.). Ferran BLASI BIRBE, Joan ESCALA MITJANS, Manuel ROIG, Albert ROVIRA SUMALLA, Pere TENA, y Roser VIDAL PIQUÉ (colaboradores): "Catàleg monumental de l'Arquebisbat de Barcelona. Volum VI/3. Santa Teresa de l'Infant Jesús. Doctora de l'Església. Santuari Parròquia de Santa Teresa de l'Infant Jesús. Barcelona". Arxiu Diocesà de Barcelona. Akribos Edicions. Barcelona, 2006.
. Josep M. MARTÍ BONET: "Santa Agnès de Malanyanes. Història i art d'una parròquia". Barcelona-Santa Agnès de Malanyanes, 2007.
. Josep M. MARTÍ BONET: "El bisbat d'Egara: breu història". 2007.
. Josep M. MARTÍ BONET: "El Palio. Orígen y evolución de la insignia pastoral de honor y de poder supraepiscopal". Biblioteca de Autores Cristianos. Madrid, 2008.
. Josep M. MARTÍ BONET: "El martiri dels temples a la diòcesi de Barcelona 1936-1939". Arxiu Diocesà de Barcelona. Barcelona, 2008.
. Josep M. MARTÍ BONET: "Sacralia. Diccionari dels catalogadors del patrimoni cultural". Arxiu Diocesà de Barcelona. Barcelona, 2010.
. Josep M. MARTÍ BONET: "La Catedral de Barcelona. Història i històries". Catedral i Museu Diocesà de Barcelona. Barcelona, 2010.